Protein–RNA interactions for Protein: Q62521

Zic3, Zinc finger protein ZIC 3, mousemouse

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic3Q62521 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Zic3Q62521 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Zic3Q62521 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms