Protein–RNA interactions for Protein: Q61345

Foxd1, Forkhead box protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd1Q61345 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Foxd1Q61345 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Foxd1Q61345 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms