Protein–RNA interactions for Protein: Q61216

Mre11, Double-strand break repair protein MRE11, mousemouse

Predictions only

Length 706 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mre11Q61216 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mre11Q61216 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mre11Q61216 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.6 ms