Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Mkrn3Q60764 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Gm13323-201ENSMUST00000120245 1151 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Mkrn3Q60764 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 271.2 ms