Protein–RNA interactions for Protein: Q60692

Psmb6, Proteasome subunit beta type-6, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb6Q60692 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Psmb6Q60692 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Psmb6Q60692 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms