Protein–RNA interactions for Protein: Q5SVP0

9930111J21Rik1, RIKEN cDNA 9930111J21 gene 1, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
9930111J21Rik1Q5SVP0 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms