Protein–RNA interactions for Protein: Q5PSV9

Mdc1, Mediator of DNA damage checkpoint protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mdc1Q5PSV9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Mdc1Q5PSV9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Mdc1Q5PSV9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Mdc1Q5PSV9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms