Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trappc1Q5NCF2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trappc1Q5NCF2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
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Trappc1Q5NCF2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trappc1Q5NCF2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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Trappc1Q5NCF2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Trappc1Q5NCF2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
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Trappc1Q5NCF2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc1Q5NCF2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc1Q5NCF2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
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Trappc1Q5NCF2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Trappc1Q5NCF2 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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