Protein–RNA interactions for Protein: Q497Q6

Fam228b, Protein FAM228B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam228bQ497Q6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Fam228bQ497Q6 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Fam228bQ497Q6 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Fam228bQ497Q6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms