Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULM6

Uspl1, SUMO-specific isopeptidase USPL1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uspl1Q3ULM6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Uspl1Q3ULM6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Uspl1Q3ULM6 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms