Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHZ5

Lmod2, Leiomodin-2, mousemouse

Predictions only

Length 550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod2Q3UHZ5 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Lmod2Q3UHZ5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Lmod2Q3UHZ5 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Lmod2Q3UHZ5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.6 ms