Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX8

Nkx6-3, Homeobox protein Nkx-6.3, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-3Q3UHX8 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Nkx6-3Q3UHX8 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Nkx6-3Q3UHX8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms