Protein–RNA interactions for Protein: Q3U308

Ctu2, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu2Q3U308 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ctu2Q3U308 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Ctu2Q3U308 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ctu2Q3U308 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms