Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Trim43aQ3TL54 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43aQ3TL54 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43aQ3TL54 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43aQ3TL54 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43aQ3TL54 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43aQ3TL54 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43aQ3TL54 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43aQ3TL54 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43aQ3TL54 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43aQ3TL54 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43aQ3TL54 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Trim43aQ3TL54 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim43aQ3TL54 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim43aQ3TL54 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Trim43aQ3TL54 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Trim43aQ3TL54 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Trim43aQ3TL54 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms