Protein–RNA interactions for Protein: Q09098

Pate4, Prostate and testis expressed protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pate4Q09098 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Pate4Q09098 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Pate4Q09098 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms