Protein–RNA interactions for Protein: Q05A06

Vmn1r236, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r236Q05A06 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vmn1r236Q05A06 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms