Protein–RNA interactions for Protein: Q03137

Epha4, Ephrin type-A receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 986 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epha4Q03137 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Epha4Q03137 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Epha4Q03137 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 138.7 ms