Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cct3P80318 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cct3P80318 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cct3P80318 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cct3P80318 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cct3P80318 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cct3P80318 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cct3P80318 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms