Protein–RNA interactions for Protein: P61082

Ube2m, NEDD8-conjugating enzyme Ubc12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2mP61082 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ube2mP61082 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ube2mP61082 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms