Protein–RNA interactions for Protein: P58545

Btbd3, BTB/POZ domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd3P58545 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Btbd3P58545 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Btbd3P58545 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms