Protein–RNA interactions for Protein: P48432

Sox2, Transcription factor SOX-2, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox2P48432 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sox2P48432 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox2P48432 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox2P48432 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox2P48432 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox2P48432 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox2P48432 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sox2P48432 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox2P48432 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sox2P48432 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms