Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cdkn1bP46414 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Cdkn1bP46414 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Cdkn1bP46414 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.9 ms