Protein–RNA interactions for Protein: P30548

Tacr1, Substance-P receptor, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tacr1P30548 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Tacr1P30548 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tacr1P30548 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tacr1P30548 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms