Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp1P29452 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp1P29452 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp1P29452 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp1P29452 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Casp1P29452 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp1P29452 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp1P29452 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp1P29452 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp1P29452 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp1P29452 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp1P29452 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casp1P29452 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Casp1P29452 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms