Protein–RNA interactions for Protein: P21107

Tpm3, Tropomyosin alpha-3 chain, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3P21107 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpm3P21107 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tpm3P21107 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tpm3P21107 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tpm3P21107 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tpm3P21107 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3P21107 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3P21107 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3P21107 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3P21107 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3P21107 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3P21107 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3P21107 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3P21107 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3P21107 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3P21107 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3P21107 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Tpm3P21107 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3P21107 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3P21107 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3P21107 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3P21107 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3P21107 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3P21107 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3P21107 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3P21107 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3P21107 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3P21107 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3P21107 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpm3P21107 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3P21107 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3P21107 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3P21107 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3P21107 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3P21107 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpm3P21107 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms