Protein–RNA interactions for Protein: P12023

App, Amyloid-beta A4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AppP12023 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AppP12023 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AppP12023 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AppP12023 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
AppP12023 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
AppP12023 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
AppP12023 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AppP12023 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AppP12023 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AppP12023 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AppP12023 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AppP12023 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AppP12023 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AppP12023 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AppP12023 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
AppP12023 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
AppP12023 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AppP12023 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AppP12023 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AppP12023 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AppP12023 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AppP12023 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AppP12023 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
AppP12023 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AppP12023 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
AppP12023 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
AppP12023 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AppP12023 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AppP12023 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AppP12023 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
AppP12023 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AppP12023 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
AppP12023 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AppP12023 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
AppP12023 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AppP12023 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AppP12023 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
AppP12023 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
AppP12023 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AppP12023 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AppP12023 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
AppP12023 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
AppP12023 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AppP12023 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
AppP12023 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AppP12023 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AppP12023 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AppP12023 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AppP12023 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AppP12023 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AppP12023 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AppP12023 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
AppP12023 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
AppP12023 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AppP12023 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AppP12023 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AppP12023 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AppP12023 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
AppP12023 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
AppP12023 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AppP12023 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AppP12023 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
AppP12023 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AppP12023 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AppP12023 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AppP12023 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AppP12023 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AppP12023 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
AppP12023 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AppP12023 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AppP12023 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AppP12023 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AppP12023 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
AppP12023 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AppP12023 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AppP12023 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AppP12023 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AppP12023 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
AppP12023 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AppP12023 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AppP12023 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AppP12023 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
AppP12023 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
AppP12023 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AppP12023 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AppP12023 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AppP12023 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
AppP12023 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AppP12023 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
AppP12023 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AppP12023 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AppP12023 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AppP12023 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AppP12023 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AppP12023 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AppP12023 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
AppP12023 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AppP12023 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
AppP12023 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
AppP12023 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms