Protein–RNA interactions for Protein: P01679

Ig kappa chain V-VI region J539, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01679 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01679 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01679 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01679 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01679 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01679 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01679 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
P01679 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01679 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01679 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01679 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01679 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01679 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01679 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01679 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01679 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01679 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01679 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01679 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01679 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01679 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01679 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01679 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
P01679 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
P01679 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01679 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01679 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01679 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01679 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01679 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01679 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01679 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01679 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
P01679 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01679 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01679 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01679 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01679 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01679 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01679 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01679 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01679 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01679 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01679 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01679 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
P01679 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01679 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01679 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01679 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01679 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01679 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01679 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01679 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01679 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01679 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01679 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01679 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01679 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01679 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
P01679 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01679 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01679 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01679 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01679 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01679 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01679 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01679 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01679 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01679 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01679 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01679 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01679 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01679 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01679 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01679 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
P01679 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01679 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01679 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01679 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01679 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01679 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01679 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
P01679 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01679 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
P01679 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
P01679 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01679 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01679 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01679 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01679 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01679 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
P01679 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01679 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01679 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01679 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01679 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
P01679 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
P01679 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01679 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
P01679 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms