Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01678 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01678 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01678 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01678 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01678 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
P01678 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01678 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01678 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01678 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01678 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01678 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01678 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
P01678 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01678 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01678 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01678 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01678 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01678 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
P01678 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
P01678 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01678 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01678 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01678 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
P01678 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01678 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01678 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01678 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01678 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01678 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01678 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01678 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
P01678 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01678 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01678 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01678 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01678 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01678 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01678 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
P01678 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01678 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01678 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01678 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01678 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01678 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
P01678 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01678 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01678 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01678 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01678 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01678 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
P01678 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01678 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01678 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01678 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01678 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01678 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01678 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01678 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01678 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
P01678 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01678 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01678 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01678 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01678 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01678 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01678 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01678 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01678 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01678 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01678 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
P01678 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01678 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01678 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01678 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01678 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01678 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01678 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01678 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
P01678 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
P01678 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01678 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01678 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01678 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01678 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01678 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01678 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01678 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
P01678 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01678 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01678 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01678 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01678 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01678 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
P01678 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01678 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01678 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01678 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01678 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
P01678 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms