Protein–RNA interactions for Protein: O88516

Dll3, Delta-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 592 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dll3O88516 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dll3O88516 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dll3O88516 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Dll3O88516 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dll3O88516 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dll3O88516 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dll3O88516 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Dll3O88516 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms