Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Slc4a4O88343 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc4a4O88343 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc4a4O88343 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.4 ms