Protein–RNA interactions for Protein: O09106

Hdac1, Histone deacetylase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac1O09106 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hdac1O09106 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac1O09106 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac1O09106 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms