Protein–RNA interactions for Protein: O08545

Efna3, Ephrin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna3O08545 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna3O08545 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna3O08545 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efna3O08545 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Efna3O08545 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna3O08545 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Efna3O08545 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Efna3O08545 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms