Protein–RNA interactions for Protein: J3QK46

Tmem200c, Transmembrane protein 200C, mousemouse

Predictions only

Length 637 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem200cJ3QK46 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem200cJ3QK46 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem200cJ3QK46 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem200cJ3QK46 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem200cJ3QK46 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem200cJ3QK46 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem200cJ3QK46 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem200cJ3QK46 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem200cJ3QK46 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem200cJ3QK46 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem200cJ3QK46 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem200cJ3QK46 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem200cJ3QK46 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Tmem200cJ3QK46 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Tmem200cJ3QK46 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Tmem200cJ3QK46 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tmem200cJ3QK46 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms