Protein–RNA interactions for Protein: F8VPX6

Speer4a, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4aF8VPX6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Speer4aF8VPX6 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Speer4aF8VPX6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms