Protein–RNA interactions for Protein: F6VRJ8

Gm8247, Predicted gene 8247 (Fragment), mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8247F6VRJ8 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm8247F6VRJ8 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm8247F6VRJ8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
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