Protein–RNA interactions for Protein: E9Q8F9

6030445D17Rik, RIKEN cDNA 6030445D17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6030445D17RikE9Q8F9 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC11.79□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
6030445D17RikE9Q8F9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
6030445D17RikE9Q8F9 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms