Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7U8

Vmn2r35, Vomeronasal 2, receptor 35, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r35E9Q7U8 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn2r35E9Q7U8 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r35E9Q7U8 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r35E9Q7U8 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r35E9Q7U8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r35E9Q7U8 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r35E9Q7U8 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r35E9Q7U8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r35E9Q7U8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r35E9Q7U8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn2r35E9Q7U8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r35E9Q7U8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r35E9Q7U8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r35E9Q7U8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r35E9Q7U8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r35E9Q7U8 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn2r35E9Q7U8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms