Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM2

1700003H04Rik, RIKEN cDNA 1700003H04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700003H04RikE9PXM2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
1700003H04RikE9PXM2 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
1700003H04RikE9PXM2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.7 ms