Protein–RNA interactions for Protein: E9PWG2

Trappc8, Trafficking protein particle complex 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc8E9PWG2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trappc8E9PWG2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trappc8E9PWG2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trappc8E9PWG2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms