Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WPV9

1700019A02Rik, RIKEN cDNA 1700019A02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700019A02RikA0A087WPV9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
1700019A02RikA0A087WPV9 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
1700019A02RikA0A087WPV9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.7 ms