Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2M6

Ubl3, Ubiquitin-like protein 3, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl3Q9Z2M6 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubl3Q9Z2M6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubl3Q9Z2M6 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ubl3Q9Z2M6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ubl3Q9Z2M6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.9 ms