Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV32

Arpc1b, Actin-related protein 2/3 complex subunit 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc1bQ9WV32 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Arpc1bQ9WV32 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Arpc1bQ9WV32 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.8 ms