Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

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Length 836 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc3Q9QZC1 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc3Q9QZC1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms