Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZ28

Six6, Homeobox protein SIX6, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six6Q9QZ28 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Six6Q9QZ28 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Six6Q9QZ28 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms