Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
VapbQ9QY76 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
VapbQ9QY76 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VapbQ9QY76 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms