Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

Predictions only

Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
OtofQ9ESF1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
OtofQ9ESF1 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
OtofQ9ESF1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
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