Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC60

Ubiad1, UbiA prenyltransferase domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubiad1Q9DC60 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ubiad1Q9DC60 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ubiad1Q9DC60 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ubiad1Q9DC60 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.1 ms