Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8F1

Alkbh4, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 4, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh4Q9D8F1 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Alkbh4Q9D8F1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Alkbh4Q9D8F1 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms