Protein–RNA interactions for Protein: Q9D806

Vstm5, V-set and transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm5Q9D806 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vstm5Q9D806 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vstm5Q9D806 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms