Protein–RNA interactions for Protein: Q9D709

Tmem79, Transmembrane protein 79, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem79Q9D709 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tmem79Q9D709 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tmem79Q9D709 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem79Q9D709 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem79Q9D709 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem79Q9D709 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem79Q9D709 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem79Q9D709 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem79Q9D709 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem79Q9D709 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tmem79Q9D709 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms